独自ドメインjpは御社のサーバーで使用出来るでしょうか？

利用可能です。移転のお客様の場合、取得会社によってはネームサーバーの変更を拒否する場合がございます。その場合、指定業者を変更する必要がございますので、拒否された場合当社までご連絡ください。